# Starting H-Bond vs N-N length analysis for these values: # bond file = "UNIQUE_HBONDS.txt" # PREFIX = "LENGTH_DETAILS" # number_sims = 36 # logfile = "LENGTH_DETAILS_logfile.txt" (this file) # # number H-Bonds to consider = 842 # # HBond types are as follows: # 0 Glycan to its nearest amino acid # 1 Glycan to another Glycan # 2 Glycan to some other amino acid # 3 Amino acid to another amino acid # 4 Glycan to itself # 5 Amino acid to itself # # #======================= Per HBond statistics ===================== # # Total number of trajectory frames scanned: 355642 #Index Type Acceptor Hydrogen Donor Frames Fraction Avg N-N 1 4 0MA_12@O2 0MA_12@H3O 0MA_12@O3 44292 0.125 10.845 2 4 0MA_12@O2 0MA_12@H6O 0MA_12@O6 6 0.000 11.640 3 1 0MA_12@O2 0MA_13@H2O 0MA_13@O2 37 0.000 11.845 4 1 0MA_12@O2 0MA_13@H3O 0MA_13@O3 188 0.001 11.094 5 1 0MA_12@O2 0MA_13@H4O 0MA_13@O4 46 0.000 11.099 6 1 0MA_12@O2 0MA_13@H6O 0MA_13@O6 419 0.001 10.896 7 1 0MA_12@O2 0MA_14@H2O 0MA_14@O2 820 0.002 12.126 8 1 0MA_12@O2 0MA_14@H3O 0MA_14@O3 669 0.002 12.343 9 1 0MA_12@O2 0MA_14@H4O 0MA_14@O4 116 0.000 11.892 10 1 0MA_12@O2 0MA_14@H6O 0MA_14@O6 323 0.001 12.714 11 1 0MA_12@O2 0MA_15@H2O 0MA_15@O2 559 0.002 11.499 12 1 0MA_12@O2 0MA_15@H3O 0MA_15@O3 510 0.001 9.798 13 1 0MA_12@O2 0MA_15@H4O 0MA_15@O4 574 0.002 9.945 14 1 0MA_12@O2 0MA_15@H6O 0MA_15@O6 667 0.002 8.859 15 2 0MA_12@O2 LYS_8@H LYS_8@N 60 0.000 9.154 16 2 0MA_12@O2 LYS_8@HZ1 LYS_8@NZ 345 0.001 7.428 17 2 0MA_12@O2 LYS_8@HZ2 LYS_8@NZ 323 0.001 7.269 18 2 0MA_12@O2 LYS_8@HZ3 LYS_8@NZ 352 0.001 7.571 19 2 0MA_12@O2 LYS_9@H LYS_9@N 988 0.003 6.335 20 2 0MA_12@O2 LYS_9@HZ1 LYS_9@NZ 319 0.001 9.067 21 2 0MA_12@O2 LYS_9@HZ2 LYS_9@NZ 310 0.001 8.851 22 2 0MA_12@O2 LYS_9@HZ3 LYS_9@NZ 337 0.001 8.898 23 2 0MA_12@O2 NHE_11@HN1 NHE_11@N 8 0.000 7.775 24 2 0MA_12@O2 NHE_11@HN2 NHE_11@N 1 0.000 9.748 25 2 0MA_12@O2 OLT_7@H OLT_7@N 76 0.000 10.423 26 4 0MA_12@O3 0MA_12@H2O 0MA_12@O2 104353 0.293 10.831 27 4 0MA_12@O3 0MA_12@H4O 0MA_12@O4 89846 0.253 10.827 28 1 0MA_12@O3 0MA_13@H2O 0MA_13@O2 427 0.001 11.987 29 1 0MA_12@O3 0MA_13@H3O 0MA_13@O3 10752 0.030 10.959 30 1 0MA_12@O3 0MA_13@H4O 0MA_13@O4 2629 0.007 10.585 31 1 0MA_12@O3 0MA_13@H6O 0MA_13@O6 739 0.002 10.727 32 1 0MA_12@O3 0MA_14@H2O 0MA_14@O2 320 0.001 11.918 33 1 0MA_12@O3 0MA_14@H3O 0MA_14@O3 669 0.002 12.557 34 1 0MA_12@O3 0MA_14@H4O 0MA_14@O4 302 0.001 12.278 35 1 0MA_12@O3 0MA_14@H6O 0MA_14@O6 632 0.002 12.418 36 1 0MA_12@O3 0MA_15@H2O 0MA_15@O2 1969 0.006 12.431 37 1 0MA_12@O3 0MA_15@H3O 0MA_15@O3 956 0.003 11.335 38 1 0MA_12@O3 0MA_15@H4O 0MA_15@O4 652 0.002 10.420 39 1 0MA_12@O3 0MA_15@H6O 0MA_15@O6 599 0.002 9.128 40 2 0MA_12@O3 LYS_8@H LYS_8@N 6 0.000 9.033 41 2 0MA_12@O3 LYS_8@HZ1 LYS_8@NZ 181 0.001 9.439 42 2 0MA_12@O3 LYS_8@HZ2 LYS_8@NZ 169 0.000 9.444 43 2 0MA_12@O3 LYS_8@HZ3 LYS_8@NZ 179 0.001 9.432 44 2 0MA_12@O3 LYS_9@H LYS_9@N 92 0.000 8.499 45 2 0MA_12@O3 LYS_9@HZ1 LYS_9@NZ 197 0.001 9.501 46 2 0MA_12@O3 LYS_9@HZ2 LYS_9@NZ 214 0.001 9.167 47 2 0MA_12@O3 LYS_9@HZ3 LYS_9@NZ 233 0.001 9.561 48 2 0MA_12@O3 NHE_11@HN1 NHE_11@N 70 0.000 6.574 49 2 0MA_12@O3 OLT_7@H OLT_7@N 120 0.000 10.832 50 4 0MA_12@O4 0MA_12@H3O 0MA_12@O3 41905 0.118 10.773 51 4 0MA_12@O4 0MA_12@H6O 0MA_12@O6 1544 0.004 10.801 52 1 0MA_12@O4 0MA_13@H2O 0MA_13@O2 60 0.000 12.537 53 1 0MA_12@O4 0MA_13@H3O 0MA_13@O3 1114 0.003 11.079 54 1 0MA_12@O4 0MA_13@H4O 0MA_13@O4 422 0.001 10.463 55 1 0MA_12@O4 0MA_13@H6O 0MA_13@O6 126 0.000 10.362 56 1 0MA_12@O4 0MA_14@H2O 0MA_14@O2 429 0.001 11.867 57 1 0MA_12@O4 0MA_14@H3O 0MA_14@O3 1826 0.005 12.156 58 1 0MA_12@O4 0MA_14@H4O 0MA_14@O4 1604 0.005 10.155 59 1 0MA_12@O4 0MA_14@H6O 0MA_14@O6 1254 0.004 10.762 60 1 0MA_12@O4 0MA_15@H2O 0MA_15@O2 1488 0.004 12.444 61 1 0MA_12@O4 0MA_15@H3O 0MA_15@O3 325 0.001 11.735 62 1 0MA_12@O4 0MA_15@H4O 0MA_15@O4 384 0.001 10.583 63 1 0MA_12@O4 0MA_15@H6O 0MA_15@O6 663 0.002 9.941 64 2 0MA_12@O4 LYS_8@H LYS_8@N 26 0.000 9.281 65 2 0MA_12@O4 LYS_8@HZ1 LYS_8@NZ 120 0.000 9.103 66 2 0MA_12@O4 LYS_8@HZ2 LYS_8@NZ 152 0.000 9.126 67 2 0MA_12@O4 LYS_8@HZ3 LYS_8@NZ 138 0.000 9.207 68 2 0MA_12@O4 LYS_9@H LYS_9@N 116 0.000 6.547 69 2 0MA_12@O4 LYS_9@HZ1 LYS_9@NZ 103 0.000 9.565 70 2 0MA_12@O4 LYS_9@HZ2 LYS_9@NZ 106 0.000 9.635 71 2 0MA_12@O4 LYS_9@HZ3 LYS_9@NZ 145 0.000 10.027 72 2 0MA_12@O4 NHE_11@HN1 NHE_11@N 5 0.000 9.809 73 2 0MA_12@O4 NHE_11@HN2 NHE_11@N 1 0.000 8.243 74 2 0MA_12@O4 OLT_7@H OLT_7@N 1023 0.003 10.342 75 4 0MA_12@O5 0MA_12@H2O 0MA_12@O2 3661 0.010 10.902 76 4 0MA_12@O5 0MA_12@H6O 0MA_12@O6 51354 0.144 10.884 77 1 0MA_12@O5 0MA_13@H2O 0MA_13@O2 72 0.000 12.241 78 1 0MA_12@O5 0MA_13@H3O 0MA_13@O3 281 0.001 11.006 79 1 0MA_12@O5 0MA_13@H4O 0MA_13@O4 5 0.000 9.625 80 1 0MA_12@O5 0MA_13@H6O 0MA_13@O6 16 0.000 10.901 81 1 0MA_12@O5 0MA_14@H2O 0MA_14@O2 406 0.001 13.013 82 1 0MA_12@O5 0MA_14@H3O 0MA_14@O3 682 0.002 10.244 83 1 0MA_12@O5 0MA_14@H4O 0MA_14@O4 238 0.001 9.723 84 1 0MA_12@O5 0MA_14@H6O 0MA_14@O6 56 0.000 11.547 85 1 0MA_12@O5 0MA_15@H2O 0MA_15@O2 415 0.001 11.457 86 1 0MA_12@O5 0MA_15@H3O 0MA_15@O3 899 0.003 9.358 87 1 0MA_12@O5 0MA_15@H4O 0MA_15@O4 396 0.001 9.229 88 1 0MA_12@O5 0MA_15@H6O 0MA_15@O6 513 0.001 9.332 89 2 0MA_12@O5 LYS_8@HZ1 LYS_8@NZ 104 0.000 7.519 90 2 0MA_12@O5 LYS_8@HZ2 LYS_8@NZ 108 0.000 7.901 91 2 0MA_12@O5 LYS_8@HZ3 LYS_8@NZ 114 0.000 7.736 92 2 0MA_12@O5 LYS_9@HZ1 LYS_9@NZ 267 0.001 7.300 93 2 0MA_12@O5 LYS_9@HZ2 LYS_9@NZ 289 0.001 7.481 94 2 0MA_12@O5 LYS_9@HZ3 LYS_9@NZ 268 0.001 7.524 95 2 0MA_12@O5 NHE_11@HN1 NHE_11@N 7 0.000 8.340 96 2 0MA_12@O5 NHE_11@HN2 NHE_11@N 3 0.000 8.931 97 0 0MA_12@O5 OLT_4@H OLT_4@N 18 0.000 10.415 98 4 0MA_12@O6 0MA_12@H2O 0MA_12@O2 16 0.000 11.159 99 4 0MA_12@O6 0MA_12@H4O 0MA_12@O4 2387 0.007 10.804 100 1 0MA_12@O6 0MA_13@H2O 0MA_13@O2 415 0.001 11.748 101 1 0MA_12@O6 0MA_13@H3O 0MA_13@O3 490 0.001 10.893 102 1 0MA_12@O6 0MA_13@H4O 0MA_13@O4 192 0.001 10.383 103 1 0MA_12@O6 0MA_13@H6O 0MA_13@O6 21 0.000 10.681 104 1 0MA_12@O6 0MA_14@H2O 0MA_14@O2 533 0.001 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